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2020年初，香港城市大学与东莞市政府、东莞理工学院签署合作办学协议，于东莞市松山湖科学城内建设具有独立法人资格的内地与香港合作办学机构——香港城市大学（东莞）。
香港城市大学（东莞）2025年硕士招生入学申请也正式启动，招生专业包括：电脑科学、商务资讯系统、电子资讯工程学、生物医学工程、材料工程及纳米科技、工程管理学、数据科学。
近期，教育部港澳台事务办公室印发《关于对长春大学等26所高校面向港澳台地区招生予以备案的函》（教港澳台办〔2024〕48号），香港城市大学（东莞）获批面向全国联招考试、台湾学测招生资格。自2025年起，该校可通过全国联招考试、台湾学测考试进行招生。
